La iglesia de Dios de Naco, estableció sus raíces a través de los principios de crecimiento de la iglesia celular o grupos pequeños de evangelización.

En 1986, la misionera Yagna Vanderlinder, inició estudios bíblicos en SODOCAR, una empresa productora de alimentos, donde ella trabajababa. Una señora de la familia Poy se convirtió al cristianismo, su nombre era Sarah. Después de que ella se salvó, otras personas de su familia se convirtierón también al cristianismo, Maria Auxilio, María Felicia, María del Refugio (Fugie) y su marido. Pero se establecieron en la iglesia La Trinidad de las Asambleas de Dios, en el Ensanche Quisqueya.

La hermana Vanderlinder, en 1991 decidió iniciar un grupo de células en la casa de la hermana María Auxilio Poy, que creció rápidamente, de manera que tenían que desplazarse hasta el estadio de la ciudad para celebrar la escuela dominical a la sombra de los árboles. Debido a este rápido crecimiento de la nueva iglesia, se tuvo que alquilar una planta en el área de Naco a mediados de 1992.

En enero 1995 la iglesia de Dios Naco había 29 miembros y alrededor de 5 nuevos creyentes y 35 personas asistiendo a la clase de escuela dominical.

En enero de 1995, llegó un nuevo pastor de forma temporal, el Rev. José A. Encarnación, Director de Educación de la Iglesia de Dios en la República Dominicana. Después de algunas consideraciones acerca de la necesidad del nuevo pastor de la iglesia, Encarnación dejó su antiguo puesto de trabajo y tomó a tiempo completo el liderazgo de la Iglesia de Dios de Naco, en julio de ese mismo año. Como la evolución de ese crecimiento continuó, tuvimos que mudarnos a un nuevo local alquilado, por la suma US$ 1,000.00 más de la mitad de lo que soliamos pagar. Sin embargo, un año más tarde, la iglesia creció a 45 miembros y cincuenta personas asistían a la Escuela Dominical.

En noviembre 1996, nos tuvimos que mudar de nuevo, pagando aquí US$2,000.00 de alquiler. En marzo de 1997, 19 de nuestros miembros se trasladarón a formar una nueva iglesia. Sin embargo el crecimiento de la Congregación no paró, porque se llegó a la misma cantidad de miembros en solo 18 meses.

Para identificar nuestro trabajo, en 1996 empezamos la iglesia llamada Centro de Adoración Naco.

En la actualidad, estamos trabajando para llegar a las personas con la estrategía de evangelización a través de grupos familiares. Nuestros grupos son llamados: Grupos Ágape, teníamos 15 grupos antes del 2000. Nosotros estamos formando nuevos ministros, quienes se serán encargados de los nuevos Grupos Agape o grupos familiares. La mayoría de nuestros miembros están involucrados en esta estrategia de evangelización.